非線形常微分方程式をときながら 非線形混合効果モデルで 個体ごとにモデルも異なる となるととても難しい。出来合いのツールがそのままでは使えない。 自分で sampler を書けばいいのだけれども、prior を書くのが面倒だ。

MS Office では最近その事故はあまり起こらない。自動保存っていいよね。 Phoenix は時々死ぬ。それは覚悟しているから自衛も働く。 それに、モデルって結構ちゃんと思い出せるから、再構築も割と簡単にできる。しかし、今日のソフト。レイアウトもので死な…

いや、タイトルに偽りありで、使ってみただけであり、まだ、成功していません。 配列がうまく渡せないようだ。サイズが違うというエラーが出る。PyMC3 の中から odeint を呼ぶとエラーが出る。 odeint 自体はちゃんと動く。 PyMC3 から解析解の PRED 関数を…

超簡単な PPK model を PyMC3 で計算してみた。線形の点滴モデル。モデル式は closed form である。ただし、「外」に出した。次の課題はモデル式を ODE で表現すること。ついでに、なんちゃって Bayes を（ちゃんとした）Bayes で計算した。VCM の点滴、、、…

混合効果モデルがうまくかけないぞ。データはどう作ればいいんだ？やっぱり、自分で MH sampling する方がトータルでは速いかなあ。

やっぱり機械学習だよなあ。PMx に機械学習をどうからめるか、だ。AI とか deep learning はまだその先だと思う。まずは機械学習である。 MCMC もいい加減、取り上げる頃合いだと思う。モデル選択をどうするか、はみんなで真剣に考える必要がある。

さわり始めてみた。 外部で関数を定義したいなあ。いや、する必要がある。PK, PK/PD のモデル式は外部でないと定義しきれないと思う。しかし、うかつに書くと、C でコンパイルされなくなる。つまり、PyMC3 の枠の中出関数を定義する必要があるはずだ。 その…

あれ、またお隣さんだ。Family name のアルファベット順なのか。

ノートを使い終わったので新しいのを持っていった。 今日予定していた仕事は前のノートにアイディアを書いていたのだった。内容覚えていない。というわけで今日の作業は別のことに切り替えました。 ノートに書いてそのまま忘れてしまう、という点では正しい…

二人の指導を始めた。どこまで私がやらないか、が大事な課題です。 いかに、各自に気づいてもらうか。試行錯誤があっても仕方がない。PMx とはそうやってでしか身につかない。 ただし、一人は vising のお客様であり、3 ヶ月しか滞在しませんから、結果が残…

ターゲット ソフトの基本的な使い方（動かし方）は習ったことがある 用語も最低限は知っている 薬物動態の基礎知識もある ゴールを最初に決める。そのために必要な知識を少しずつ解説する。 したがって、本論に不要なことは説明しない。データ Full sampling…

「良い」共変量モデルとはどういうものだろうか。それはもちろん、モデルの使用目的による。 たいていの場合、そのモデルを用いて何らかの予測がしたいはずだ。母集団での分布を予測したい。ある特定の患者の予測をしたい。 その目的をはっきりさせてからモ…